Hallo,
ich habe meinen Hauptwohnsitz offiziell aus steuerlichen
Günden noch bei meinen Eltern, so daß ich höhere Fahrtkosten
absetzen kann.
Cleveres Kerlchen, das Paulchen… 
(Sorry, konnt ich mir nicht verkneifen)
Kann ich mein Auto auch problemlos beim
Zweitwohnsitz anmelden
Grundsätzlich kannst Du Dein Auto auch am Zweitwohnsitz anmelden, dieser muß auch nicht im Ausweis eingetragen werden. Du mußt der Zulassungsstelle lediglich eine Meldebescheinigung vom Zweitwohnsitz vorlegen. Auch die Versicherung macht i.d.R. keine Probleme, die richten sich nach dem Zulassungsort, weil unterstellt wird, das dort am meisten gefahren wird. Ob das nun stimmt oder nicht, ist eine andere Frage. Die Versicherung kann und wird es nicht überprüfen 
ohne daß das Finanzamt früher oder
später rummeckert und auch aufgrund der Ummeldung des Autos
den Status „Zweitwohnsitz“ in Frage stellt?
Das ist ein anderes Problem. Der Status Zweitwohnsitz hängt vom Lebensmittelpunkt ab. Wer will denn nachweisen, das es nicht so ist? Probleme sehe ich eher auf einer anderen Seite. Du setzt doch sicherlich (wie Du am Rande erwähnst) die gefahrenen Kilometer von Wohnung zur Arbeitsstätte ab. Oder? Dabei bist Du doch bestimmt absolut ehrlich und setzt nur die tatsächlich gefahrenen Kilometer ab. Oder?
Mal im Ernst. Probleme könntest Du bekommen, wenn das FA Dir unterstellt, Du würdest nicht die weitere Strecke, sondern stattdessen von Deinem Zweitwohnsitz (kürzer?) zur Arbeit fahren. Aber diese Probleme haben nix mit dem Autokennzeichen zu tun. Denn es ist prinzipiell egal, mit welchem Auto Du zur Arbeit fährst. Theoretisch könnte ich Dir auch kostenlos mein Auto mit B-Kennzeichen zur Verfügung stellen. Daraus folgert noch niemand, das Du jetzt täglich von B aus zur Arbeit fährst.
Hier sind nur die echten Verhältnisse ausschlaggebend.
Also hol Dir Dein Kennzeichen. Wenn Du nebenbei auch noch Versicherungsprämie sparen kannst… Umso besser. Hier in Berlin haben sehr viele (die ich kenne und andere) ihr Auto auf dem Wochenendgrundstück angemeldet, weil´s billiger wird.
So long.
Der Dicke MD.
PS: Brauchst Du jetzt nicht mehr unter Versicherungen zu posten, da tät ich Dir das gleiche antworten 