Hallo,
ein kompletter Durchlauf kann - u.a .abhängig von Größe und Art des Datenträgers sowie Menge der zu untersuchenden Dateien - schon mal einine Stunden dauern.
Mehr als 10 Stunden und nur 2% - ist nun aber doch ein wenig zu lange.
Starte mal einen Suchlauf mit einer Antiviren-CD wie
http://scareware.de/download/rescue-boot-cds/
Herunterladen, brennen und System von CD aus starten.
Die Überprüfung eines bereits von Schädlingen befallenen Systems durch dieses „erkrankte“ System selbst ist immer ein wenig problematisch. Es gibt durchaus Schädlinge, die Antivirenprogramme erkennen und sich wehren.
Parallel solltest du mal eine der gefundenen Dateien auf eine Seite wie
http://virustotal.com
hochladen, um auszuschliessen, daß es sich um einen Fehlalarm handelt. Kann nie schaden.
Sollte es herausstellen, daß dein System wirklich durch einen Trojaner infiziert ist, solltest du eine Neuinstallation ins Auge fassen.
Viel Erfolg
godam