Hallo,
Die zentrale Frage ist: Welche Fluglinien sind es? Beziehungsweise: Hast du die Flüge separat gebucht oder werden einfach zwei Strecken von zwei verschiedenen Fluglinien durchgeführt (oder hat sogar ein Flug eine Code Share-Flugnummer der anderen)?
Beispiel: Du buchst Berlin - Brüssel mit Easyjet und getrennt davon Brüssel - Ouagadougou mit Brussels. Dann sind das zwei getrennte Flüge und du musst in Brüssel aus dem Transitraum, dein Gepäck abholen und wieder bei der zweiten Fluglinie einchecken, wie Ralph schon sagte.
Anders ist es zum Beispiel, wenn du von Berlin mit Germanwings nach Wien fliegst und mit Austrian Arrows weiter nach Klagenfurt. Weil beide zur Lufthansa-Gruppe gehören (und beide auch eine OS-Flugnummer haben), wird das Gepäck natürlich durchgecheckt.
Letzterer Fall ist sicher weitaus häufiger, deswegen müsstest du schon etwas konkreter werden…
Beste Grüße,
Bernd