Hallo Markus,
Du findest auf der dev.mysql.com Seite den mysql Workbench, ich aebeite meistens mit dem, wenn ich eine GUI brauche. Ansonsten auf toadsoft.com mal schauen. Solltest Du gerne MS Produkte verwenden, so kannst Du auch die MySQL über den OBDC mit denen verbinden und so MS-Access oder MS-Visio zusammen mit MySQL benutzen. Habe das vor Jahren mal gemacht, leider kam da Visio mit dem reverse engineering der MySql nicht so gut klar.
Der Powerdesigner von sybase ist auch recht gut, allerdings auch teuer, dafür hat der eine 15 Tage Trial Version.
Im Webumfeld wird auch viel mit phpMyAdmin gearbeitet, wäre vielleicht auch eine Alternative.
Ein gutes GUI Tool, daß ein vernünftiges Arbeiten mit ER-Diagrammen und der mysql DB bietet habe ich leider selber auch noch nicht gefunden, aber auch noch nie wirklich benötigt, auch nicht bei sehr komplexen Anwendungen.
Beste Grüße
Steffen